#4 · 主分类: 生物信息学与基因组学

Assemblies-of-putative-SARS-CoV2-spike-encoding-mRNA-sequences-for-vaccines-BNT-162b2-and-mRNA-1273

提供COVID-19疫苗mRNA的实验序列数据,以促进RNA-seq研究中疫苗来源读段的识别。

项目最后更新:12/14/21

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做高通量RNA测序的人,如果想把疫苗来源的序列和真正的SARS-CoV-2信号区分开,这份资料会很有用。项目公开了从莫德纳和辉瑞/BioNTech疫苗瓶底剩余液中实验组装出的刺突蛋白编码mRNA序列——莫德纳那款当时没有公开的完整序列,这里给出了可用的组装结果;辉瑞那款则验证了此前报道的序列。临床和科研团队做变异株监测,或者设计PCR、LAMP检测时,都可以拿这些序列来识别样本里的治疗性mRNA,避免把它误判成宿主或病毒来源。文档还详细写了湿实验和测序流程,从核酸提取、模板转换扩增到链特异性分析都有,想重复这个方法的实验室能省不少摸索的功夫。这是一份学术性的数据集加实验方案,不是可安装的软件,更适合当作参考资源来查。

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