#3 · 主分类: 生物信息学与基因组学

chemprop

chemistry drug-discovery machine-learning neural-networks

用于分子性质预测的消息传递神经网络

项目最后更新:08/21/26

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把分子结构转成可靠的性质预测,是化学家和做计算药物发现的人经常要面对的实际问题,而Chemprop正是解决这个问题的常用工具之一。它采用消息传递神经网络,直接从分子图和SMILES输入学习,省去了手动构造特征向量的麻烦。用整理好的数据集训练后,它可以预测水溶性、毒性等指标,而且自带的命令行工具、Python接口和示例笔记本能让你很快跑通第一个模型。2.x版本对包进行了重构,设计更模块化、更容易扩展,在默认配置之上添加自定义的特征化器或网络层也变得更方便。对于小分子筛选和ADMET评估这类工作,它是个实用的起点,省得自己从零实现消息传递的那套机制。

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