生物信息学与基因组学

涵盖DNA/RNA测序数据分析、变异检测、序列比对及基因组解读等开源AI工具与流程,支持自托管部署。

共 11 个项目

排名逻辑见 方法论 ;同类排名基于 GitHub 公开指标。

第 1–11 项,共 11 个

排名 项目 Stars Forks
1 deepvariant

DeepVariant是一个分析流程,利用深度神经网络从下一代DNA测序数据中识别遗传变异。

3.8K 799
2 scanpy

Python中的单细胞分析。可扩展至超过1亿个细胞。

2.5K 766
3 chemprop

用于分子性质预测的消息传递神经网络

2.4K 757
4 Assemblies-of-putative-SARS-CoV2-spike-encoding-mRNA-sequences-for-vaccines-BNT-162b2-and-mRNA-1273

提供COVID-19疫苗mRNA的实验序列数据,以促进RNA-seq研究中疫苗来源读段的识别。

3.4K 474
5 scvi-tools

单细胞和空间组学数据的深度概率分析

1.7K 471
6 alphafold3-pytorch

在Pytorch中实现Google Deepmind的Alphafold 3

1.7K 229
7 CLAM

计算病理学的开源工具 - Nature BME

1.7K 517
8 ClawBio

🦖 ClawBio - 首个生物信息学原生的AI智能体技能库。本地优先。可复现。开放。免费。

1.1K 256
9 bioSkills

一套用于生物信息学的SKILLS.md,适用于claude code等代理

1.2K 214
10 TDC

治疗学通用(TDC):治疗科学的多模态基础

1.3K 223
11 alphafold2

最终成为Alphafold2的非官方Pytorch实现/复现,随着架构细节的发布。

1.6K 264