#12 · 主分类: 生物信息学与基因组学
Open-AF3
基于论文《Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold3》的AlphaFold3的PyTorch实现。
项目最后更新:08/28/26
GitHub Stars
806
Forks数量
104
贡献者数量
7
许可证
MIT
收录理由
结构生物学与药物研发团队若想绕开DeepMind闭源代码来使用AlphaFold3,这个PyTorch重实现提供了可读性很强的参考。仓库把完整流程拆成模块化组件:pairformer主干、MSA模块,以及负责把原始原子坐标去噪成预测结构的扩散模块,每个部分都附有简短可运行的示例。由于它基于纯PyTorch张量构建,且可通过pip安装,对希望按自身输入调整架构、或追踪置信度头如何估算逐原子与成对误差的研究者来说,是一个实用的起点。需要留意的是,这是独立的社区实现,并非开箱即用的训练模型,更适合作为研究基础,而非生产级结构预测服务。
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